Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NCOA1Q15788 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NCOA1Q15788 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms