Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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