Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.81□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms