Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB39AQ14964 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RAB39AQ14964 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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