Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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RFTN1Q14699 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RFTN1Q14699 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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