Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERV3-1Q14264 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253 ms