Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDE6HQ13956 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms