Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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