Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDH18Q13634 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms