Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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