Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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TCIRG1Q13488 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TCIRG1Q13488 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCIRG1Q13488 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TCIRG1Q13488 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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TCIRG1Q13488 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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TCIRG1Q13488 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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TCIRG1Q13488 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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