Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1BQ13112 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1BQ13112 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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