Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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