Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms