Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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HOXC5Q00444 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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HOXC5Q00444 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HOXC5Q00444 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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