Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD8P13378 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD8P13378 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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