Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXA3O43365 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXA3O43365 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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