Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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USP18Q9UMW8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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USP18Q9UMW8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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