Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CGGBP1Q9UFW8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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