Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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