Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP43Q70EL4 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP43Q70EL4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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