Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP30Q70CQ3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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USP30Q70CQ3 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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