Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC142Q17RM4 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC142Q17RM4 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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