Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDO1Q16878 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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