Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ME3Q16798 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ME3Q16798 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ME3Q16798 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms