Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
SMN1Q16637 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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