Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF239Q16600 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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