Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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SNAPC1Q16533 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNAPC1Q16533 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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