Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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