Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD1Q15797 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD1Q15797 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.1 ms