Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HERC1Q15751 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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