Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ALX1Q15699 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
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