Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HMGN3Q15651 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms