Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23BQ15437 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23BQ15437 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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