Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PUM3Q15397 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PUM3Q15397 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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