Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERC3Q15034 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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