Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NCAPHQ15003 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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