Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ODF1Q14990 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ODF1Q14990 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ODF1Q14990 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ODF1Q14990 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ODF1Q14990 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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