Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IRF3Q14653 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IRF3Q14653 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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