Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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UBE4AQ14139 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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UBE4AQ14139 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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UBE4AQ14139 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE4AQ14139 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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