Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A3Q14050 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A3Q14050 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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