Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms