Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDH18Q13634 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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