Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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