Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF4BQ13523 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF4BQ13523 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms