Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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