Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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