Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFRD2Q12894 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFRD2Q12894 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms