Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KCNMA1Q12791 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KCNMA1Q12791 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.2 ms