Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PGGT1BP53609 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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